Je te confirme, mp3gain modifie le fichier (c'est aussi une option prévue avec replaygain, exploitable dans foobar), mp3gain est d'ailleurs basé sur les modules de scan de replaygain.
je suis parti d'un fichier mp3 d'où j'avais supprimé les tags,en utilisant mp3gain, on voit apparaitre des éléments stockés au niveau des tags, mais on peut en option de mp3gain eviter l'inscription de ces infos ce qui fait que le retour arrière devient impossible, par contre on voit apparaitre des modifications dans le fichier lui même. Si l'on fait l'opération avec replaygain, on voit aussi apparaitre des infos au niveau tag, par contre le fichier ne semble pas contenir de modifs internes.
Pour ce qui concerne wavegain, les fichiers sont modifiés et actuellement il n'y a pas d'infos stockées et donc le retour arrière n'est pas possible.